研究中證明細胞系平臺能夠模擬癌癥的遺傳異質性和藥物響應

       8月1日，國際學術期刊Cancer Cell 在線發表了中國科學院分子細胞科學**創新中心（生物化學與細胞生物學研究所）惠利健研究組、中國科學院上海營養與健康研究所李亦學研究組、第二軍醫大學附屬東方肝膽外科醫院張海斌研究組以及南京大學醫學院附屬鼓樓醫院施曉雷等合作的研究成果“A Pharmacogenomic Landscape in Human Liver Cancers”。該研究公布了目前**的肝癌細胞模型庫LIMORE（Liver Cancer Model Repository）及最詳細的藥物基因組學，為肝癌特異性藥物基礎與臨床研究提供了戰略性的體外研究模型。

　　原發性肝癌異質性顯著，耐藥性突出，預后不良。不同國家地區之間肝癌致病因素差異明顯，對肝癌的精準治療帶來嚴重挑戰。全球每年超過50%的新增病例和死亡病例均發生在中國。因此科學家們多年來致力于基于藥物基因學分析發掘新的潛在的治療策略和分子標志物。

　由大量細胞系構成的細胞系平臺在乳腺癌、肺癌等癌癥研究中證明細胞系平臺能夠模擬癌癥的遺傳異質性和藥物響應，通過細胞系平臺可以發現與藥物敏感性相關的分子標志物。但是對于肝癌來說，目前發表的細胞系只有30株左右，不足以反映肝癌的基因組異質性，特別是HBV相關的肝癌。

　　此次研究公布的肝癌細胞模型庫LIMORE包含81株肝癌細胞系，其中31株商業化肝癌細胞系，50株新建中國肝癌患者肝癌細胞系。通過大規模測序數據分析，證明LIMORE能反映原位腫瘤80%的異質性。進一步整合高通量藥物篩選數據，研究人員建立了肝癌基因變異與藥物響應相關性，發現了新的治療靶點和分子標志物，為索拉非尼應答患者的預測提供了DKK1血清學指標。

　　該研究優化了體外培養體系，構建了50株新的肝癌細胞系，整合已有的31株肝癌細胞系，構建了目前**的肝癌細胞系平臺；詳細描繪了81株肝癌細胞系突變譜和基因表達譜，并提供了肝癌細胞系遺傳背景和藥物響應數據庫；通過整合分析肝癌細胞系藥物響應和基因組數據，描繪了肝癌藥物基因組學的“藍圖”，發現了新的潛在的治療策略和分子標志物。

　　生化與細胞所邱志欣博士、博士研究生章正濤和中國科學院上海營養與健康研究所李虹副研究員為本文共同**作者，生化與細胞所惠利健、中國科學院上海營養與健康研究所李亦學、第二軍醫大學附屬東方肝膽外科醫院張海斌和南京大學醫學院附屬鼓樓醫院施曉雷為本文共同通訊作者。

研究得到了中國科學院、國家自然科學基金、上海市科委、科技部和中組部的資助。該工作得到了生化與細胞所化學生物學技術平臺、動物實驗技術平臺、分子生物學技術平臺、細胞分析技術平臺的大力支持。