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免疫共沉淀(CoIP)是研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法

發(fā)表時間:2019-06-28 15:39

  免疫共沉淀(CoIP)是研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法,其基于抗體和蛋白的特異性親和作用,通過捕獲與蛋白或抗原特異性結(jié)合的抗體,進(jìn)而從復(fù)雜的樣品中捕獲及富集目標(biāo)蛋白,同時可以測定與之相互作用的蛋白或其它生物大分子。

免疫沉淀(IP)則主要是利用抗體特異性反應(yīng)純化富集目的蛋白的一種方法。

20190104-2.png

免疫(共)沉淀(IP/CoIP)主要實驗流程見上圖:

(1)轉(zhuǎn)染表達(dá)目的蛋白的質(zhì)粒后,后續(xù)主要是轉(zhuǎn)染表達(dá)目的蛋白的質(zhì)粒(2)對樣本的裂解處理,(3)蛋白和抗體、珠子的孵育,(4)免疫復(fù)合物沉淀洗滌之后,(5)再進(jìn)行后續(xù)分析,常規(guī)是做WB,也有用質(zhì)譜分析的。


可以看出,CoIP本身的實驗流程并不復(fù)雜,只是為了拿到靠譜又漂亮的結(jié)果、需要我們不斷優(yōu)化實驗條件,包括裂解液的選擇、抗體的選擇、Protein A與G的選擇和使用量、beads的選擇等。

小編收集了以下常見的免疫(共)沉淀需注意點:

1.   細(xì)胞裂解采用溫和的裂解條件,不能破壞細(xì)胞內(nèi)存在的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,多采用非離子變性劑(NP40 或Triton X-100)。每種細(xì)胞的裂解

      條件是不同的,需要通過經(jīng)驗和試驗確定。不能用高濃度的變性劑(0.2%SDS),細(xì)胞裂解液中要加各種酶抑制劑。

2.   免疫(共)沉淀最需要注意點就是抗體的性質(zhì)。抗體不同、其和抗原的結(jié)合能力也不同,WB、IHC能結(jié)合未必能用在IP反應(yīng)。建議仔細(xì)檢查抗體的

     說明書。特別是多抗的特異性是問題。

3.   需充分考慮抗體/緩沖液的比例。抗體過少則不能檢出抗原,過多則不能沉降在beads上,殘存在上清。緩沖劑太少則不能溶解抗原,過多則抗原

     被稀釋。

4.   如果拿到免疫復(fù)合物后用WB檢驗,必須在實驗前預(yù)測目的蛋白是什么,以選擇最后檢測的抗體,若預(yù)測不正確,實驗就得不到結(jié)果,實驗本身具有

     冒險性。



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