一類新的稱為環(huán)狀 RNA（circular RNA, circRNA）的 RNA 可能發(fā)揮著一種有趣的作用

隨著新技術(shù)允許科學(xué)家們深入研究基因組和外顯子組，一類新的稱為環(huán)狀 RNA（circular RNA, circRNA）的 RNA 可能發(fā)揮著一種有趣的作用。

在一項新的研究中，來自美國密歇根大學(xué)的研究人員對多種癌癥中的 circRNA 進行了編目，并進行了初步研究，表明這些穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)可能作為血液或尿液中的癌癥生物標志物。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在 2019 年 2 月 7 日的 Cell 期刊上，論文標題為「The Landscape of Circular RNA in Cancer」。

circRNA 是一種非編碼 RNA，它們形成閉合的環(huán)狀結(jié)構(gòu)而不是線性結(jié)構(gòu)。新的 RNA 測序方法曝光了這些 circRNA，但是人們對它們起作用的原因或方式知之甚少。不過它們的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)使得它們成為癌癥生物標志物的理想候選對象。

這項新的研究確定了癌癥中的 circRNA 目錄，從而為未來的研究構(gòu)建了一個數(shù)據(jù)庫。論文共同通訊作者、密歇根大學(xué)轉(zhuǎn)化病理學(xué)中心主任 Arul M. Chinnaiyan 博士說，「我對 circRNA 作為非侵入性生物標志物的潛力感到非常興奮。鑒于它們的穩(wěn)定性，我們可能能夠在癌癥患者的血液或尿液中檢測到它們。這可能對癌癥的診斷或預(yù)后有用。」

作為 MiONCOSEQ 項目的一部分，這些研究人員從 800 多個腫瘤樣本中發(fā)現(xiàn)了 circRNA。他們證實為 MiONCOSEQ 項目開發(fā)的捕獲 RNA 測序在檢測 circRNA 方面比現(xiàn)有方法更為強大。

Chinnaiyan 說，「這種捕獲方法可能是有限的，這是因為它基于我們用來捕獲 RNA 的探針。但是，全外顯子組捕獲方法使得它具有重大的意義。我們通過這種方式捕獲大量的 RNA。這就是為何我們能夠鑒定出如此多的之前并不知道的 circRNA。」

這種技術(shù)僅需少量總 RNA 就能夠鑒定出 circRNA。這意味著它們可能在 RNA 被稀釋的地方被檢測到，比如血液或尿液。

此外，這些研究人員還鑒定出幾種在前列腺癌組織中發(fā)現(xiàn)的 circRNA。通過評估來自前列腺癌細胞的 circRNA，他們發(fā)現(xiàn)它們比線性 RNA 更穩(wěn)定。它們也可在尿液樣品中檢測到。

Chinnaiyan 說，「我們能夠證實這些 circRNA 存在于尿液中并且來自前列腺癌的 circRNA 可被檢測到。我們未來的研究將探究這些 circRNA 作為尿液或血液中的癌癥生物標志物。」

這些研究人員將他們的研究結(jié)果轉(zhuǎn)變?yōu)橐粋€名為 MiOncoCirc 的數(shù)據(jù)庫，這個數(shù)據(jù)庫對腫瘤樣本中報道的 circRNA 進行編目。這種資源可供科學(xué)家們使用，有助于開發(fā)新的癌癥生物標志物。