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人遺傳小腦共濟(jì)失調(diào)PCR檢測試劑盒產(chǎn)品特點(diǎn)

發(fā)表時(shí)間:2020-02-20 16:11

人遺傳小腦共濟(jì)失調(diào)PCR檢測試劑盒產(chǎn)品特點(diǎn):

PCR引物設(shè)計(jì)的目的是為了找到一對(duì)合適的核苷酸片段,使其能有效地?cái)U(kuò)增模板DNA序列。因此,引物的優(yōu)劣直接關(guān)系到PCR的特異性與成功與否。

要設(shè)計(jì)引物首先要找到DNA序列的保守區(qū)。同時(shí)應(yīng)預(yù)測將要擴(kuò)增的片段單鏈?zhǔn)欠裥纬啥?jí)結(jié)構(gòu)。如這個(gè)區(qū)域單鏈能形成二級(jí)結(jié)構(gòu),就要避開它。如這一段不能形成二級(jí)結(jié)構(gòu),那就可以在這一區(qū)域設(shè)計(jì)引物。

現(xiàn)在可以在這一保守區(qū)域里設(shè)計(jì)一對(duì)引物。一般引物長度為15-30堿基,擴(kuò)增片段長度為100-600堿基對(duì)。

讓我們先看看P1引物。一般引物序列中G+C含量一般為40%-60%。而且四種堿基的分布隨機(jī)。不要有聚嘌呤或聚嘧啶存在。否則P1引物設(shè)計(jì)的就不合理。應(yīng)重新尋找區(qū)域設(shè)計(jì)引物。

同時(shí)引物之間也不能有互補(bǔ)性,一般一對(duì)引物間不應(yīng)多于4個(gè)連續(xù)堿基的互補(bǔ)。

引物確定以后,可以對(duì)引物進(jìn)行必要的修飾,例如可以在引物的5′端加酶切位點(diǎn)序列;標(biāo)記生物素、熒光素、等,這對(duì)擴(kuò)增的特異性影響不大。但3′端絕對(duì)不能進(jìn)行任何修飾,因?yàn)橐锏难由焓菑?′端開始的。這里還需提醒的是3′端不要終止于密碼子的第3位,因?yàn)槊艽a子第3位易發(fā)生簡并,會(huì)影響擴(kuò)增的特異性與效率。


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